О закрытии издание объявило в своем заявлении на сайте. 9 ноября «Новая газета» отключит серверы и уйдёт из здания, в котором редакция находилась почти 30 лет. Журналисты сообщили, что получили требование освободить помещение, а одновременно с этим лишились возможности получать пожертвования от читателей. По мнению редакции, прекратить работу её заставили российские власти и спецслужбы.
«Это — не только наша частная история. Это — история страны и общества, которых добивают точно так же. Делают это ФСБ, Минюст, прокуратура и прочие, кто приватизировал государство и узурпировал власть. Это не советский ресентимент, под его вывеской почти построена военная диктатура», — говорится в заявлении.
В 2022 году Басманный суд признал недействительной регистрацию «Новой газеты», тогда же перестала выходить её печатная версия. В июле 2023 года вооружённые люди избили журналистку издания Елену Милашину. В сентябре того же года Минюст признал главреда Дмитрия Муратова иноагентом, после чего он покинул пост. В апреле 2026 года в редакции прошли обыски по делу журналиста Олега Ролдугина, а в сентябре Минюст признал иноагентом само издание.